石羊河流域位于甘肃河西走廊东端，河流起源于南部祁连山，消失于巴丹吉林和腾格里沙漠之间的民勤盆地北部。由东向西，主要由大靖河、古浪河、黄羊河、杂木河、金塔河、西营河、东大河、西大河等８条河流组成，除大靖河外，中部６条河于武威城附近汇成石羊大河干流入红崖山水库后进入民勤盆地，西大河及东大河部分在永昌城北汇成金川河入金川峡水库后进入金昌盆地。
石羊河流域水资源经过多年的开发利用，不断支撑着区域经济的发展和人民生活水平的提高，但与此同时，过度的水资源利用，产生了一系列生态环境问题，开始威胁流域的可持续发展，有些地方甚至已危及人类生存。实施石羊河流域综合治理，成为流域目前最紧迫的任务。
- 水资源短缺，供需矛盾十分突出
石羊河流域水资源量约１７亿ｍ３，灌溉面积约２９万ｈｍ２，人口约２２３万人，分别是甘肃内陆河地区水资源总量、总灌溉面积、总人口的约１／４、１／２、１／２。目前流域水资源利用率已很高，现状流域水资源毛利用率（用水量与水资源量比）达１５４％，净利用率（耗水量与水资源量比）超过９５％，远远超出了国际公认的合理利用率。由于中游对水资源的过度使用，进入民勤盆地的地表水量大大减少，已远远不能满足当地工农业生产的发展需求，为了维持生产的正常发展，不得不过量掘井取水，使超采地下水的状况愈演愈烈，目前年超采地下水大约３．５亿ｍ３，造成地下水位每年以大约０．５～１．０ｍ的速度普遍而又持续地下降。中游地区超采地下水的情况也普遍存在，地下水位下降趋势亦不乐观。
过度的水资源利用和持续的地下水位下降，产生了一系列生态环境问题，流域现状的社会经济发展是以牺牲生态环境和长远利益为代价而取得的。
- 生态环境恶化主要表现在河流源头区和尾闾区
在源头区由于人们的乱砍滥伐和超载放牧，造成祁连山区的乔木林和灌木林破坏严重，草场退化，祁连山灌木林下线比２０世纪５０年代上移约４０ｍ，３０％的灌木林区出现草原化和荒漠化。部分地区不断毁林毁草、开荒种地，严重毁坏林草植被，加之近几年又大兴淘金热，更加剧了林草植被的毁坏，导致水土流失，河流洪枯流量变化剧烈，水源涵养功能急剧下降。
进入尾闾民勤盆地的地表水量大大减少，超采地下水的状况愈演愈烈，使原本依赖地下水生长的沙枣林、梭梭及天然白刺等植物枯萎和死亡，使固沙的灌木林地带因水分亏缺而退化、衰败，削弱了防沙固沙和对绿洲的保护能力，大片土壤沙漠化。民勤绿洲的萎缩和土地沙化，也加重了风沙和沙尘暴的危害。这些灾难性天气不仅严重威胁着石羊河流域人民的生产、生活，而且对全省乃至西北、华北的生态环境也产生了不可低估的影响。民勤地区生态恶化形势已成燃眉之急。
- 水资源配置不合理，农业耗用水量过多
目前流域内灌溉面积过大，复（套）种比例过高，灌水技术相对落后，种植结构不尽合理，致使农业用水效率偏低，耗用水量过大，占总用水量的９０％以上。严重挤占生态用水，导致生态环境恶化。尤其在地下水严重超采的情况下，局部地区仍在扩大耕地面积，这种错误行为仍未得到有效的控制。
- 水污染形势严峻，水质持续恶化
城市生活污水、工业废水处理率不高，加之农业生产中使用农药、化肥所产生的面源污染，致使流域水质恶化，水污染严重。现状进入红崖山水库的水质为Ｖ类，加快了民勤盆地地下水的恶化趋势。民勤盆地现状地下水矿化度每年增加大约０．１２ｇ／Ｌ，矿化度高达２～４ｇ／Ｌ，最高地区达８ｇ／Ｌ，致使盆地北部的５万多人、１１万多头牲畜饮水十分困难。许多人不得不背井离乡，成为“生态难民”。
- 缺乏权威、高效的流域统一管理机构和行之有效的管理机制
现状流域水资源管理基本上处于一种各自为政的无序状态，体制不全，机制不顺，水价不合理，法规体系未健全。更关键的问题是公民自觉守法意识不够，执法力度不强，水事活动各行其是，纠纷频发。缺乏权威、高效的流域统一管理机构和行之有效的管理机制，是流域水资源利用失控和生态环境恶化的根本原因之一。
